Zvýšení citlivosti pro detekci mutací v 15. exonuAPC genu u pacientů s familiární adenomatóznípolypózou


Increased Sensitivity for Detection of Mutations in Exon 15 of the APCGene in Patients with Familial Adenomatous Polyposis

Background.
Protein Truncation Test (PTT) was used to detect mutations in exon 15 of the APC gene in patientswith Familial Adenomatous Polyposis. This method is limited by its ability to detect polypetide chains up to a certainminimum length. The aim of this study was to increase the sensitivity of detection of mutations in this region byusing the technique of Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE).Methods and Results. Study were performed on 122 patients without detected mutations in the APC gene. Thepatients were divided into two independent groups 15A and 15A+15B (with 51 and 71 patients respectively). Allthe patients were tested with the DGGE and the positive findings were confirmed with sequencing. No mutation wasdetected in the group 15A (0 %). In group 15A+15B one (1,4 %) polymorphism and four (5,63 %) patients withnonsense mutations were detected.Conclusions. DGGE is an effective method for detecting mutations in the first part of exon 15 of APC gene. It allowsdetecting any change in DNA strand. DGGE complements PTT in scanning of the whole exon 15 of APC gene.

Key words:
familial adenomatous polyposis, adenomatous polyposis coli, APC gene, denaturing gradient gelelectrophoresis.


Autoři: D. Konvalinka;  E. C. Bik 1;  C. M. Tops 1;  E. Bakker 1;  A. R. Singh;  R. Vrtěl;  J. Šantavý
Působiště autorů: Ústav lékařské genetiky a fetální medicíny LF UP a FN, Olomouc 1Center for Human and Clinical Genetics, LUMC, Leiden, The Netherlands
Vyšlo v časopise: Čas. Lék. čes. 2004; : 543-546
Kategorie: Články

Souhrn

Východisko.
Detekce mutací v 15. exonu APC genu u pacientů s familiární adenomatózní polypózou je prováděnapomocí Protein Truncation Testu (PTT) na základě přítomnosti zkráceného proteinu. Citlivost metody je omezenaschopností detekovat polypeptid o určité minimální velikosti. Cílem práce je zvýšit citlivost pro sledování výskytumutací v tomto úseku za použití denaturační gradientové gelové elektroforézy (DGGE).Metody a výsledky. Vyšetření bylo provedeno na souboru 122 pacientů, u nichž skrínink celého APC genu neodhalilpřítomnost žádné mutace. Soubor byl rozdělen na dvě nezávislé skupiny:15A a 15A+15B (51, resp. 71 vyšetřovaných).Vzorky DNA všech pacientů byly testovány za použití DGGE. Pozitivní nálezy byly ověřeny sekvenacípříslušných úseků na automatickém sekvenátoru. Ve skupině 15A nebyla ve sledovaném úseku nalezena mutaceu žádného z pacientů (0 %). U skupiny 15A+15B byl zjištěn polymorfizmus u 1 (1,4 %) pacienta a 4 (5,63 %)pacienti se stop mutací.Závěry. Metoda DGGE se ukázala jako účinná technika pro detekci mutací v počáteční oblasti 15. exonuAPC genu.Umožňuje odhalit jakoukoli změnu v řetězci DNA (viz záchyt polymorfizmu). Tímto vhodně doplňuje vlastnostiPTT pro výzkum celého 15. exonu.

Klíčová slova:
familiární adenomatózní polypóza, adenomatózní polyposis coli, APC gen, denaturační gradientovágelová elektroforéza.

Plné znění tohoto článku není v digitalizované podobě.
V případě zájmu kontaktujte NTO ČLS JEP, které vám může poskytnout sken časopisu.

Štítky
Adiktologie Alergologie a imunologie Angiologie Audiologie a foniatrie Biochemie Dermatologie Dětská gastroenterologie Dětská chirurgie Dětská kardiologie Dětská neurologie Dětská otorinolaryngologie Dětská psychiatrie Dětská revmatologie Diabetologie Farmacie Chirurgie cévní Algeziologie Dentální hygienistka

Článek vyšel v časopise

Časopis lékařů českých


Nejčtenější v tomto čísle

Tomuto tématu se dále věnují…


Kurzy

Zvyšte si kvalifikaci online z pohodlí domova

Imunitní trombocytopenie (ITP) u dospělých pacientů
nový kurz
Autoři: prof. MUDr. Tomáš Kozák, Ph.D., MBA

Pěnová skleroterapie
Autoři: MUDr. Marek Šlais

White paper - jak vidíme optimální péči o zubní náhrady
Autoři: MUDr. Jindřich Charvát, CSc.

Hemofilie - série kurzů

Faktory ovlivňující léčbu levotyroxinem
Autoři:

Všechny kurzy
Kurzy Doporučená témata Časopisy
Přihlášení
Zapomenuté heslo

Nemáte účet?  Registrujte se

Zapomenuté heslo

Zadejte e-mailovou adresu se kterou jste vytvářel(a) účet, budou Vám na ni zaslány informace k nastavení nového hesla.

Přihlášení

Nemáte účet?  Registrujte se

VIRTUÁLNÍ ČEKÁRNA ČR Jste praktický lékař nebo pediatr? Zapojte se! Jste praktik nebo pediatr? Zapojte se!

×