Identifikace určujících regulátorů a role HLA allel


Autoři: P. Barták
Vyšlo v časopise: Čas. Lék. čes. 2012; 151: 479

Trans-acting genetické varianty mají významnou, ale spíše náhodnou roli v dědičné determinaci genové exprese. Ve studii byly použity páry čištěných primárních monocytů a B-buněk a přitom identifikovány nové predominantně buněčně specifické typy specific cistrans exprese quantitative trait loci (eQTLs), včetně multi-locus trans associace LYZKLF4 v monocytech a v B buňkách. K tomu byly pozorovány specifické B-buněčné trans asociace rs11171739 at 12q13.2, známý lokus autoimunních chorob s IP6K2 (p = 5,8 × 10-15), PRIC285 (p = 3,0 × 10-10) a upstream region CDKN1A (p = 2 × 10-52), signalizující cyklickou regulaci a peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ) nabízející autoimunitní patogenezu. Také byly nalezeny HLA peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ) allely z trans asociace s expresí AOAHARHGAP24 v monocytech, nikoliv v B-buňkách. Studie ukazuje, že mapování genové exprese v primární buněčné populaci identifikuje nový buněčný typ-specificky trans-regulované sítě a poskytující vhled do genetické báze sklonu k chorobám.

P. Barták


Zdroje

Fairfax BP, et al.: Genetics of gene expression in primary immune cells identifies cell type-specific master regulators and roles of HLA alleles. Nature Genetics 2012; 44: 502–510.

Štítky
Adiktologie Alergologie a imunologie Angiologie Audiologie a foniatrie Biochemie Dermatologie Dětská gastroenterologie Dětská chirurgie Dětská kardiologie Dětská neurologie Dětská otorinolaryngologie Dětská psychiatrie Dětská revmatologie Diabetologie Farmacie Chirurgie cévní Algeziologie Dentální hygienistka

Článek vyšel v časopise

Časopis lékařů českých


Nejčtenější v tomto čísle

Tomuto tématu se dále věnují…


Kurzy

Zvyšte si kvalifikaci online z pohodlí domova

Ulcerative colitis_muž_břicho_střeva
Ulcerózní kolitida
nový kurz
Autoři:

Blokátory angiotenzinových receptorů (sartany)
Autoři: MUDr. Jiří Krupička, Ph.D.

Antiseptika a prevence ve stomatologii
Autoři: MUDr. Ladislav Korábek, CSc., MBA

Citikolin v neuroprotekci a neuroregeneraci: od výzkumu do klinické praxe nejen očních lékařů
Autoři: MUDr. Petr Výborný, CSc., FEBO

Zánětlivá bolest zad a axiální spondylartritida – Diagnostika a referenční strategie
Autoři: MUDr. Monika Gregová, Ph.D., MUDr. Kristýna Bubová

Všechny kurzy
Kurzy Doporučená témata Časopisy
Přihlášení
Zapomenuté heslo

Nemáte účet?  Registrujte se

Zapomenuté heslo

Zadejte e-mailovou adresu, se kterou jste vytvářel(a) účet, budou Vám na ni zaslány informace k nastavení nového hesla.

Přihlášení

Nemáte účet?  Registrujte se