#PAGE_PARAMS# #ADS_HEAD_SCRIPTS# #MICRODATA#

What is ancestry?


Autoři: Iain Mathieson aff001;  Aylwyn Scally aff002
Působiště autorů: Department of Genetics, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania, United States of America aff001;  Department of Genetics, University of Cambridge, Cambridge, United Kingdom aff002
Vyšlo v časopise: What is ancestry?. PLoS Genet 16(3): e32767. doi:10.1371/journal.pgen.1008624
Kategorie: Opinion Piece
doi: https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008624


Zdroje

1. Donnelly KP. The probability that related individuals share some section of genome identical by descent. Theoretical Population Biology. 1983;23(1):34–63. doi: 10.1016/0040-5809(83)90004-7 6857549

2. Coop G. How many genetic ancestors do I have? https://gcbias.org/2013/11/11/how-does-your-number-of-genetic-ancestors-grow-back-over-time/ Accessed 11/4/19 2013.

3. Griffiths RC, Marjoram P. An ancestral recombination graph. In: Donnelly P, Tavaré S, editors. Progress in Population Genetics and Human Evolution. Berlin: Springer-Verlag; 1997. p. 257–70.

4. Li H, Durbin R. Inference of human population history from individual whole-genome sequences. Nature. 2011;475(7357):493–6. doi: 10.1038/nature10231 21753753

5. Schiffels S, Durbin R. Inferring human population size and separation history from multiple genome sequences. Nat Genet. 2014;46(8):919–25. doi: 10.1038/ng.3015 24952747

6. Rasmussen MD, Hubisz MJ, Gronau I, Siepel A. Genome-wide inference of ancestral recombination graphs. PLoS Genet. 2014;10(5):e1004342. doi: 10.1371/journal.pgen.1004342 24831947

7. Speidel L, Forest M, Shi S, Myers SR. A method for genome-wide genealogy estimation for thousands of samples. Nat Genet. 2019;51(9):1321–9. doi: 10.1038/s41588-019-0484-x 31477933

8. Kelleher J, Wong Y, Wohns AW, Fadil C, Albers PK, McVean G. Inferring whole-genome histories in large population datasets. Nat Genet. 2019;51(9):1330–8. doi: 10.1038/s41588-019-0483-y 31477934

9. Pickrell JK, Pritchard JK. Inference of population splits and mixtures from genome-wide allele frequency data. PLoS genetics. 2012;8(11):e1002967. doi: 10.1371/journal.pgen.1002967 23166502

10. Patterson N, Moorjani P, Luo Y, Mallick S, Rohland N, Zhan Y, et al. Ancient admixture in human history. Genetics. 2012;192(3):1065–93. doi: 10.1534/genetics.112.145037 22960212

11. Alexander DH, Novembre J, Lange K. Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals. Genome Res. 2009;19(9):1655–64. doi: 10.1101/gr.094052.109 19648217

12. Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000;155(2):945–59. 10835412

13. Lawson DJ, Hellenthal G, Myers S, Falush D. Inference of population structure using dense haplotype data. PLoS Genet. 2012;8(1):e1002453. doi: 10.1371/journal.pgen.1002453 22291602

14. Li N, Stephens M. Modeling linkage disequilibrium and identifying recombination hotspots using single-nucleotide polymorphism data. Genetics. 2003;165(4):2213–33. 14704198

15. Skoglund P, Mathieson I. Ancient genomics of modern humans: The first decade. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2018;19 : 381–404. doi: 10.1146/annurev-genom-083117-021749 29709204


Článek vyšel v časopise

PLOS Genetics


2020 Číslo 3
Nejčtenější tento týden
Nejčtenější v tomto čísle
Kurzy

Zvyšte si kvalifikaci online z pohodlí domova

Mepolizumab v reálné klinické praxi kurz
Mepolizumab v reálné klinické praxi
nový kurz
Autoři: MUDr. Eva Voláková, Ph.D.

BONE ACADEMY 2025
Autoři: prof. MUDr. Pavel Horák, CSc., doc. MUDr. Ludmila Brunerová, Ph.D., doc. MUDr. Václav Vyskočil, Ph.D., prim. MUDr. Richard Pikner, Ph.D., MUDr. Olga Růžičková, MUDr. Jan Rosa, prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc., Dr.h.c.

Cesta pacienta nejen s SMA do nervosvalového centra
Autoři: MUDr. Jana Junkerová, MUDr. Lenka Juříková

Svět praktické medicíny 2/2025 (znalostní test z časopisu)

Eozinofilní zánět a remodelace
Autoři: MUDr. Lucie Heribanová

Všechny kurzy
Kurzy Podcasty Doporučená témata Časopisy
Přihlášení
Zapomenuté heslo

Zadejte e-mailovou adresu, se kterou jste vytvářel(a) účet, budou Vám na ni zaslány informace k nastavení nového hesla.

Přihlášení

Nemáte účet?  Registrujte se

#ADS_BOTTOM_SCRIPTS#