Genotypy a geografický výskyt virových variant klíšťové encefalitidy

14. 5. 2019

V oblasti výzkumu klíšťové encefalitidy byl učiněn velký skok v poznání různých variant tohoto nebezpečného viru. Pomocí nejnovějších genetických metod je dnes možné velmi rychle určit přesnou variantu viru a také zjistit, kde na světě se daná varianta viru nejčastěji vyskytuje.

Inzerce

V oblasti výzkumu klíšťové encefalitidy byl učiněn velký skok v poznání různých variant tohoto nebezpečného viru. Pomocí nejnovějších genetických metod je dnes možné velmi rychle určit přesnou variantu viru a také zjistit, kde na světě se daná varianta viru nejčastěji vyskytuje.

Nové genové sondy přesně určí složení viru

Pro studium genetické variability a genotypů RNA viru klíšťové encefalitidy byl vytvořen panel deoxyoligonukleotidových sond. Pomocí metod molekulární hybridizace pak tyto sondy, tvořené přesným řetězcem dusíkatých bází (adenin, guanin, cytosin, uracil), nasedají na specifická vazebná místa v RNA viru klíšťové encefalitidy. Postupnou změnou pořadí dusíkatých bází v sondě pak vědci byli schopni odhalit jednotlivé změny v řetězci RNA a tím určit různé varianty viru klíšťové encefalitidy, které existují.

Nalezené varianty byly dále zkoumány z hlediska jejich výskytu v oblasti Evropy a Asie. Výzkum přesných variant tohoto viru a místa jejich výskytu slouží k tomu, aby byla léčba klíšťové encefalitidy více cílená a tím účinnější a úspěšnější.

Co odhalil výzkum genotypů

Metodou molekulární hybridizace bylo tedy s pomocí těchto panelů možno určit genotypy, ale zejména varianty genotypů a podjednotky genotypů tohoto viru. Předešlé poznatky o existenci 5 genotypů viru klíšťové encefalitidy byly potvrzeny. Jeden panel je schopný rozpoznat až 268 dosud archivovaných izolátů viru a každý z nich přiřadit k jeho genotypu.

Široce rozšířené, a tedy z hlediska epidemiologie velmi důležité jsou zejména tři genotypy, nazvané podle regionu svého výskytu genotyp evropský, genotyp sibiřský a genotyp Dalekého východu. Tyto tři genotypy zahrnují drtivou většinu objevených izolátů. Čtvrtý genotyp se vyskytuje pouze v oblasti ruského města Irkutsk a je představován pouze jedním izolátem viru. Pátý genotyp zahrnuje 10 izolátů, ale je velmi vzácný.

Lepší znalostí viru se zlepšuje i očkování

Díky identifikaci genotypů lze očkování proti viru klíšťové encefalitidy cílit na geograficky odpovídající variantu.

(ercp)

Zdroje:
J Med Virol. 2010 May; 82 (6): 965–76.

Štítky
Infekční lékařství
Kurzy Doporučená témata Časopisy
Přihlášení
Zapomenuté heslo

Nemáte účet?  Registrujte se

Zapomenuté heslo

Zadejte e-mailovou adresu se kterou jste vytvářel(a) účet, budou Vám na ni zaslány informace k nastavení nového hesla.

Přihlášení

Nemáte účet?  Registrujte se