Corynebacterium sp. izolovaný z hemokultury bakteriemického pacienta. Potvrdí se předpoklady o novém korynebakteriu?

Stáhnout PDF English version

Autoři: L. Mališová ^1,8; P. Ježek ²; J. Dresler ³; M. Chmel ^3,4; P. Španělová ⁵; M. Musílek ⁶ ; R. Šafránková ^5,7; H. Žemličková ^1,7,8
Působiště autorů: National Reference Laboratory for Antibiotics, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic ¹; Department of Clinical Microbiology and Parasitology, Regional Hospital Příbram, Czech Republic ²; Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic ³; Department of Infectious Diseases, First Faculty of Medicine, Charles University and Military University Hospital, Prague, Czech Republic ⁴; Czech National Collection of Type Cultures, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic ⁵; National Reference Laboratory for Meningococcal Infection, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic ⁶; Department of Clinical Microbiology, Faculty of Medicine and University Hospital, Charles University, Hradec Kralove, Czech Republic ⁷; Department of Microbiology, 3rd Faculty of Medicine Charles University, University Hospital Královské Vinohrady and National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic ⁸
Vyšlo v časopise: Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. 70, 2021, č. 4, s. 285-290
Kategorie: Krátké sdělení

Souhrn

Kazuistika suspektní septikemie s izolací raritního kmene Corynebacterium sp. Izolace tohoto kmene ani kmenů geneticky blízkých druhů z klinického materiálu nebyla zatím v dostupné literatuře popsána. V článku jsou uvedeny kromě stručného klinického popisu také morfologické a biochemické vlastnosti, metody identifikace a vyšetření k antibiotikům. Cílem práce bylo především upozornit na nový a vzácně se vyskytující kmen korynebakteria.

Klíčová slova:

WGS – Corynebacterium sp. – septokemie – hemokultura

Zdroje

1. Aravena-Román M, Spröer C, Siering C, et al. Corynebacterium aquatimens sp. nov., a lipophilic Corynebacterium isolated from blood cultures of a patient with bacteremia. Syst Appl Micobiol., 2012;35 : 380–384.

2. Bernard K. The Genus Corynebacterium and Other Medically Relevant Coryneform-Like Bacteria. J Clin Microbiol., 2012;50(10):3152–3158.

3. Emms DM, Kelly S. OrthoFinder: phylogenetic orthology inference for comparative genomics. Genome Biol, 2019;20 : 238.

4. Funke G, von Graevenitz A, Claridge III JE, et al. Clinical microbiology of coryneform bacteria. Clin Microbiol Rev., 1997;10(1):125 –⁠ 159.

5. Ježek P, Zavadilová J, Kolínská R, et al. Corynebacterium imitans isolated from blood culture of a patient with suspected bacteraemia –⁠ the first isolate of this species from human clinical material in the Czech Republic. Clin Microbiol Inf Med., 2014;20(3):98–100.

6. Joussen AM, Funke G, Joussen F, et al. Corynebacterium macginleyi: a conjunctiva specific pathogen. Br J Ophtalmol., 2000;84 : 1420–1422.

7. Koren S, Walenz BP, Berlin K, et al. Canu: scalable and accurate long-read assembly via adaptive k/mer weighting and repeat separation. Genome Res., 2017;27 : 722–736.

8. Maiwald M. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice. Washington, DC, 2. edition, 2011; ISBN: 9781555814977.

9. Stamatakis A. RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies. Bioinformatics, 2014;30(9):1312–1313.

10. Vlasatá V, Zavadilová J, Koukolová K, et al. Corynebacterium in the bloodstream of humans. Bulletin of CEM, 2017;26(11 –⁠ 12):408–410.

11. Walker BJ, Abeel T, Shea T, et al. Pilon : an integrated tool for comprehensive microbial variant detection and genome assembly improvement. PLoS One, 2014;9(11).