-
Články
- Vzdělávání
- Časopisy
Top články
Nové číslo
- Témata
- Kongresy
- Videa
- Podcasty
Nové podcasty
Reklama- Práce v oboru
Doporučené pozice
Reklama- Praktické
Characteristics of the ID-NOW™ test for the rapid detection of SARS-CoV-2
Authors: Z. Kepka; A. Briksi; P. Hubáček
; M. Zajac; P. Dřevínek
Authors place of work: Ústav lékařské mikrobiologie 2. lékařské fakulty Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice v Motole, Praha
Published in the journal: Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. 72, 2023, č. 1, s. 3-8
Category: Původní práce
Summary
Objective: To determine the sensitivity and specificity of the Abbott ID-NOW™ test in the diagnosis of COVID-19. The test is based on the detection of the SARS-CoV-2 gene by isothermal amplification technology.
Methods: From 303 individuals, two nasopharyngeal swabs and one oropharyngeal swab were collected to be tested in parallel by the ID-NOW™ test and PCR test (Allplex™ SARS-CoV-2 Assay). A subgroup of 107 individuals presented to the public collection point for covid-19 at the Motol University Hospital during the dominance of the Delta variant, and the others were tested via the Adult Emergency Admission Department during the dominance of the Omicron variant.
Results: Of 297 valid samples, 43 were positive by the PCR assay and 33 were positive by the ID-NOW™ test (sensitivity 76.74%; 95% CI 61.37 to 88.24%). ID-NOW™ detected three samples as positive, but the positivity was not confirmed by PCR (specificity 98.82%; 95% CI 96.59 to 99.76%). A significant increase in sensitivity up to 100% is observed for samples with a higher viral load (with a PCR threshold cycle value below 30 or from patients with symptoms of COVID-19). The Delta or Omicron variant has no significant effect on the sensitivity of the test.
Conclusion: Due to its ease of use and speed of result, ID-NOW™ is a suitable diagnostic tool for prompt assessment of a patient’s infectivity. If, despite the negative ID-NOW™ result, the patient has symptoms of COVID-19, it is advised to perform a classic PCR test for SARS-CoV-2.
Keywords:
POCT – sensitivity – SARS-CoV-2 – ID-NOW™
Zdroje
1. Onemocnění aktuálně: COVID19: Přehled aktuální situace v ČR [online]. 2022-07-08 [cit. 2022-07-08]. Dostupné na www: <https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19>.
2. World Health Organization. Recommendations for national SARS - -CoV-2 testing strategies and diagnostic capacities [online]. 2021 - 06-25 [cit. 2022-03-24]. Dostupné na www: <https://www.who. int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-lab-testing-2021. 1-eng>.
3. Ministerstvo zdravotnictví ČR. Vybrané indikátory stavu a šíření epidemie a denní souhrn testů na COVID-19 k 03. 02. 2022 [online]. 2022-02-03 [cit. 2022-07-30]. Dostupné na www: <https://www. mzcr.cz/tiskove-centrum-mz/vybrane-indikatory-stavu-a-sireni - epidemie-a-denni-souhrn-testu-na-covid-19-k-3-2-2022/>.
4. Arshadi M, Fardsanei F, Deihim B, et al. Diagnostic Accuracy of Rapid Antigen Tests for COVID-19 Detection: A Systematic Review With Meta-analysis. Front Med, 2022;9 : 870738.
5. Dřevínek P, Hurych J, Kepka Z, et al. Citlivost testů antigenu SARS-CoV-2 z hlediska testování ve velkém měřítku. Epidemiol Mikrobiol Imunol, 2021;70(3):156–160.
6. Maples BK, Holmberg RC, Miller AP, et al. Nicking and Extension Amplification Reaction for the Exponential Amplification of Nucleic Acids [online]. 2009 [cit. 2022-07-30]. Dostupné na www: <https://patents.google.com/patent/US9689031B2, US20140072978A1. U.S. Patent >.
7. Stürenburg E, Junker R. Point-of-Care Testing in Microbiology. Dtsch Arztebl Int, 2009;106(4):48–54.
8. Sepulda JL, Abdulbaki R, Sands Z, et al. Performance of the Abbott ID NOW rapid SARS-CoV-2 amplification assay in relation to nasopharyngeal viral RNA loads. J Clin Virol, 2021;140 : 104843.
9. Ramachandran A, Noble J, Deutcher A. Performance of Abbott ID‐Now rapid nucleic amplification test for laboratory identification of COVID‐19 in asymptomatic emergency department patients. J Am Coll Emerg Physicians Open, 2021; 2(6):e12592.
10. Barnacle JR, Houston H, Baltas I, et al. Diagnostic accuracy of the Abbott ID NOW SARS-CoV-2 rapid test for the triage of acute medical admissions. J Hosp Infect, 2022;123 : 92–99.
11. Patel MR, Carroll D, Ussery E, et al. Performance of Oropharyngeal Swab Testing Compared With Nasopharyngeal Swab Testing for Diagnosis of Coronavirus Disease 2019 – United States, January 2020–February 2020. Clin Infect Dis, 2021;72(3):403–410.
12. Srivastava S, Singh P, Malhotra R, et al. Comparison of Abbott ID NOW, a novel isothermal amplification based COVID-19 diagnostic method with RTPCR. J Virol Methods, 2022;304 : 114521.
13. van Kampen JJA, van de Vijver DAMC, Fraaij PLA, et al. Duration and key determinants of infectious virus shedding in hospitalized patients with coronavirus disease-2019 (COVID-19). Nat Commun, 2021;12(1):267.
14. Jaafar R, Aherfi S, Wurtz N, et al. Correlation Between 3790 Quantitative Polymerase Chain Reaction–Positives Samples and Positive Cell Cultures, Including 1941 Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Isolates. Clin Infect Dis, 2021;72(11):e921.
15. Scheiblauer H, Filomena A, Nitsche A, et al. Comparative sensitivity evaluation for 122 CE-marked rapid diagnostic tests for SARS-CoV-2 antigen, Germany, September 2020 to April 2021. Euro Surveill, 2021;26(44):2100441.
16. Avanzato VA, Matson MJ, Seifert SN, et al. Case Study: Prolonged Infectious SARS-CoV-2 Shedding from an Asymptomatic Immunocompromised Individual with Cancer. Cell, 2020;183(7):1901 – 1912.e9
17. Kemp SA, Collier DA, Datir RP, et al. SARS-CoV-2 evolution during treatment of chronic infection. Nature, 2021;592(7853):277–282.
18. World Health Organization. Diagnostic testing for SARS-CoV-2 Interim guidance [online]. 2020-09-11 [cit. 2022-08-01]. Dostupné na www: <https://www.who.int/publications/i/item/ diagnostic-testing-for-sars-cov-2 >.
19. Kortüm S, Krause M, Ott HJ, et al. Molecular point-of-care testing for SARS-CoV-2 using the ID NOW™ System in Emergency Department: Prospective Evaluation and Implementation in the Care Process. MedRxiv [online] 2021-09-13. [cit. 2022-08-01] Dostupné na www: <https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2 021.09.09.21263266v1.full.pdf+html >.
Štítky
Hygiena a epidemiologie Infekční lékařství Mikrobiologie
Článek vyšel v časopiseEpidemiologie, mikrobiologie, imunologie
Nejčtenější tento týden
2023 Číslo 1- Perorální antivirotika jako vysoce efektivní nástroj prevence hospitalizací kvůli COVID-19 − otázky a odpovědi pro praxi
- Parazitičtí červi v terapii Crohnovy choroby a dalších zánětlivých autoimunitních onemocnění
- Vakcíny proti klíšťové encefalitidě
- Kdy je nejlepší očkovat
-
Všechny články tohoto čísla
- Acute rotavirus infection causes significant activation of the IL-33/IL-13 axis
- Postoje sester a studentů ošetřovatelství k očkování proti covid-19 – přehled
- Charakteristika testu ID-NOW™ určeného k rychlé detekci SARS-CoV-2
- Črevná mikrobiota, jej vzťah k imunitnému systému a možnosti jej modulácie
- Multilokulární infekce způsobené hypervirulentní Klebsiella pneumoniae
- Za akademikom, profesorom MUDr. Jánom Štefanovičom, DrSc.
- MUDr. Helena Šrámová, CSc. (*31. 7. 1942 – †2. 2. 2023)
- Zvláštnosti Q horečky a dosud zaznamenané humánní případy v České republice
- Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie
- Archiv čísel
- Aktuální číslo
- Informace o časopisu
Nejčtenější v tomto čísle- Črevná mikrobiota, jej vzťah k imunitnému systému a možnosti jej modulácie
- Multilokulární infekce způsobené hypervirulentní Klebsiella pneumoniae
- Zvláštnosti Q horečky a dosud zaznamenané humánní případy v České republice
- Charakteristika testu ID-NOW™ určeného k rychlé detekci SARS-CoV-2
Kurzy
Zvyšte si kvalifikaci online z pohodlí domova
Revma Focus: Spondyloartritidy
nový kurz
Autoři: prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc., Dr.h.c., doc. MUDr. Václav Vyskočil, Ph.D., MUDr. Petr Kasalický, CSc., MUDr. Jan Rosa, Ing. Pavel Havlík, Ing. Jan Adam, Hana Hejnová, DiS., Jana Křenková
Autoři: MDDr. Eleonóra Ivančová, PhD., MHA
Autoři: prof. MUDr. Eva Kubala Havrdová, DrSc.
Autoři: prof. MUDr. Pavel Horák, CSc., doc. MUDr. Ludmila Brunerová, Ph.D., doc. MUDr. Václav Vyskočil, Ph.D., prim. MUDr. Richard Pikner, Ph.D., MUDr. Olga Růžičková, MUDr. Jan Rosa, prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc., Dr.h.c.
Všechny kurzyPřihlášení#ADS_BOTTOM_SCRIPTS#Zapomenuté hesloZadejte e-mailovou adresu, se kterou jste vytvářel(a) účet, budou Vám na ni zaslány informace k nastavení nového hesla.
- Vzdělávání