Nalezena nová varianta genu TYK2 zvyšující riziko roztroušené sklerózy

Cílem studie, na které spolupracovalo několik kanadských a britských pracovišť, bylo identifikovat vzácně se vyskytující genové varianty významně zvyšující riziko vzniku roztroušené sklerózy (RS). Autoři studie se zaměřili na rodinu s častým výskytem tohoto onemocnění, kde se v průběhu 4 generací objevilo 15 případů RS.

Metoda

Autoři studie provedli sekvenaci exomu ve skupině pacientů trpících RS, aby identifikovali neobvyklé genové varianty přispívající ke zvýšenému výskytu RS uvnitř zkoumané rodiny. Výskyt potenciálně významných genových variant byl poté zjišťován v širší skupině pacientů.

Výsledky

V rámci studie byl osekvenován exom u čtyř členů zkoumané rodiny trpících RS. Celkem bylo nalezeno 21 583 genových variant sdílených těmito rodinnými příslušníky. Při bližším prozkoumání těchto variant byla identifikována jedna nová mutace (rs55762744) v genu pro tyrozinkinázu 2 (gen TYK2). Odlišný typ polymorfismu uvnitř tohoto genu byl naopak již v rámci starší rozsáhlé studie identifikován jako protektivní ve vztahu k RS.

Nově identifikovaná varianta genu TYK2 je missense mutace (záměna nukleotidu mající za následek vložení jiné aminokyseliny) a byla nalezena u 72 % (10 ze 14) členů zkoumané rodiny trpících RS a u 47 % (28 z 60) členů rodiny bez onemocnění RS.

Závěr

Rs55762744 je vzácná genová varianta, která mírně zvyšuje riziko výskytu RS u svých nositelů. V rámci zkoumané rodiny je mutace rs55762744 běžná a může významněji ovlivnit riziko vzniku RS. Sekvenování exomu je rychlá a efektivní metoda a uvedená studie dokládá užitečnost sekvenování jen několika málo členů v rámci jediné rodiny k identifikaci nové genové varianty. Sekvenování dalších členů rodiny může pomoci odhalit další genové mutace důležité pro vznik RS.

(vek)

Zdroj: Dyment D. A. et al. Exome sequencing identifies a novel, multiple sclerosis susceptibility variant in the TYK2 gene. Neurology. 2012 Jun 27. [Epub ahead of print]; doi:10.1212/WNL.0b013e3182616fc4